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真核mRNA測序5-6G

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真核mRNA測序5-6G
服務(wù)介紹:轉(zhuǎn)錄組測序(mRNA-seq):基于Illumina測序平臺(tái),對(duì)某一物種或特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下產(chǎn)生的mRNA進(jìn)行高通量測序,既可以提供定量分析,檢測基因表達(dá)水平差異,又可以提供結(jié)構(gòu)分析,發(fā)現(xiàn)稀有轉(zhuǎn)錄本,并且對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行功能注釋。

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真核mRNA測序5-6G

服務(wù)介紹:

轉(zhuǎn)錄組測序(mRNA-seq):基于Illumina測序平臺(tái),對(duì)某一物種或特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下產(chǎn)生的mRNA進(jìn)行高通量測序,既可以提供定量分析,檢測基因表達(dá)水平差異,又可以提供結(jié)構(gòu)分析,發(fā)現(xiàn)稀有轉(zhuǎn)錄本,并且對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行功能注釋。

名稱

規(guī)格

真核mRNA測序5-6G

/個(gè)樣

真核mRNA測序10-12G

/個(gè)樣

 

 

實(shí)驗(yàn)流程:

樣本處理-TotalRNA抽提與質(zhì)檢-文庫構(gòu)建-PE150測序-數(shù)據(jù)分析;

送樣運(yùn)輸要求:

1)樣品類型:細(xì)胞、動(dòng)物新鮮組織、植物組織、全血、血清、血漿、石蠟切片、或RNA樣品。

2)樣品的量:新鮮動(dòng)物組織 ≥100mg(含肌纖維或脂肪等組織的樣品 RNA 含量較低,送樣量需增加)。新鮮培養(yǎng)細(xì)胞 ≥5×106 個(gè)(請清洗后離心得細(xì)胞沉淀,用 TRIzol 充分裂解并干冰運(yùn)輸)。新鮮全血 ≥1mL(新鮮血液樣本,不可使用凍存血。建議向新鮮血液中加入 3 倍體積的 TRIzol LS 裂解液,干冰運(yùn)輸)。血清,血漿(一般是用至少2ml的全血分離出來的量)。PBMC>1*107(加Trzol混勻,避免反復(fù)凍融)。植物組織 ≥1g(含多糖多酚等的復(fù)雜植物組織,請盡可能多的送樣)。石蠟切片5-10 張/卷(未經(jīng) HE 染色的切片;厚度≥5µm;組織區(qū)域面積≥10mm×10mm;有核細(xì)胞比例>80%;腫瘤細(xì)胞比例>20%。建議使用 1 年內(nèi)的 FFPE 樣本)。

3)樣品質(zhì)量:RNA無明顯降解,提取的總RNA OD260/280值在1.8~2.2之間,濃度 ≥ 500 ng/μl,28S:18S ≥ 1.5,RIN ≥ 7。

4)樣品保存:細(xì)胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)可用TRIZOL或RNA保護(hù)劑處理或液氮凍存后,-80℃保存。RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中,-80℃保存。樣品保存期間避免反復(fù)凍融。

5)樣品運(yùn)輸:樣品置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰運(yùn)輸。

 

 


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